Yayasan Amir Ash-Shiddiiqi menyadari bahwa lingkungan masyarakat sangat berpengaruh terhadap tumbuh kembang anak pada usia sekolah. Lingkungan pendidikan yang baik akan melahirkan generasi yang baik pula.
Boarding School (Sekolah Asrama) merupakan lingkungan pendidikan yang baik untuk menciptakan generasi terbaik.
Pada tahun 2014 Yayasan Amir Ash-Shiddiiqi mendirikan Lembaga Pendidikan SMP IT ( Boarding School) dan pada tahun
2017 SMP IT Ash-Shiddiiqi meluluskan angkatan pertama dengan Perolehan Nilai UN tertinggi di Kabupaten Batanghari.
Selanjutnya pada tahun 2017, Yayasan Amir Ash-Shiddiiqi mendirikan SMA IT (juga Islamic Boarding School).
Untuk mengakomodir minat siswa yang ingin mendalami Pendidikan Agama Islam dan melanjutkan pendidikan ke Timur Tengah, maka pada Tahun 2023 Yayasan Amir Ash-Shiddiiqi mendirikan Madrasah Aliyah (MA) di bawah naungan Kementerian Agama. MA Ash-Shiddiiqi khusus untuk jurusan Pendidikan Agama Islam. Sedangkan bagi siswa yang ingin mendalami ilmu pendidikan umum dapat melanjutkan pendidikan ke SMA IT Ash-Shiddiiqi.
Alhamdulillah Pondok Pesantren Ash-Shiddiiqi telah memiliki sertifikat Mu'adalah, sebagai bukti bahwa Pondok Pesantren Ash-Shiddiiqi sudah diakui oleh Perguruan tinggi Al-Azhar Mesir. Sehingga lebih memudahkan
siswa Pondok Pesantren Ash-Shiddiiqi untuk melanjutkan Pendidikan Tinggi di Wilayah Timur Tengah.
Lembaga Pendidikan Ash-Shiddiiqi terus meningkatkan kualitas layanan Pendidikan, salah satunya dengan cara melakukan Inovasi Pendidikan. Lembaga Pendidikan Ash-Shiddiiqi telah melakukan Inovasi Pendidikan Berbasis Digital, yakni siswa memakai ipad sebagai alat belajar. Sehingga kegiatan proses belajar menjadi lebih berkualitas dan menyenangkan.
SMP-SMA IT dan MA Ash-Shiddiiqi membuka Penerimaan peserta didik baru untuk Tahun Ajaran 2025/2026, dengan jumlah siswa baru SMP 6 kelas, SMA menerima 4 kelas dan MA menerima 4 kelas.